MSGRANUL: GRANULOMETRIA BASEADA EM CORRELAÇÃO E MSER APLICADA À CONTAGEM DE COLÔNIAS DE BACTÉRIAS

JOEL M. S. JUNIOR¹; SIMONE C. BALIAN²; HAE YONG KIM¹

¹ Escola Politécnica, Universidade de São Paulo; ² Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo

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Resumo

Contar colônias de bactérias tem vasta aplicação no campo das ciências biológicas. Esta prática pode fornecer importantes informações com diferentes finalidades, contudo, trata-se de uma tarefa repetitiva e trabalhosa que requer mão de obra especializada. Vários pesquisadores têm procurado automatizar esta tarefa. Neste artigo, será proposta uma nova abordagem para contar colônias, chamada de MSGranul. Apresentaremos sua teoria e fundamento, avaliaremos seu desempenho em 19 imagens contendo bactérias Staphylococcus aureus e compararemos o seu desempenho com o OpenCFU, um software de código aberto desenvolvido para esta tarefa.

Palavras-chave: colônia de bactérias; granulometria; MSER; visão computacional; reconhecimento de padrões; contagem automática