Identificação de Genes Relacionados com a Resposta do Feijoeiro à Desidratação e ao Frio

Débora Regiane Gobatto; Taciane Finatto

doi:10.20906/CPS/SICITE2015-0726

Resumo

Durante a aclimatação das plantas ao frio ocorrem mudanças na expressão gênica e acúmulo de proteínas. Algumas plantas, sob baixas temperaturas produzem proteínas anticongelamento que se ligam às superfícies de cristais de gelo para impedir ou retardar seu crescimento evitando o rompimento da célula. O objetivo deste estudo foi identificar in silico, os genes de Phaseolus vulgaris L. capazes de sintetizar estas proteínas. Utilizou-se o banco de dados National Center for Biotechnology Information (NCBI) para buscar as sequências de aminoácidos que formam as proteínas anticongelamento em diferentes plantas. No banco de dados Phytozome (v. 10.2) foi realizado um alinhamento local utilizando a ferramenta tBLASTn, que realiza uma busca no banco de aminoácidos traduzidos, usando uma sequência de proteínas, contra o genoma de P. vulgaris. Foram anotadas as sequências alinhadas, escore (bits), identidade (%), E-value, seu loco nos cromossomos do feijão e sua função. No banco de dados NCBI foram encontradas 117 sequências de aminoácidos cuja função está associada às proteínas anticongelamento, dessas, 52 contém alguma semelhança com genes de P. vulgaris, sendo 18 com identidade maior que 55% e E-value menor que e-10. Entre as 18 sequências que apresentam maior similaridade com genes de P. vulgaris, 61% são provenientes da espécie Ammopiptanthus mongolicus, também da família Fabaceae, que é uma planta de clima desértico. Estes genes identificados em feijoeiro serão alvo de estudos futuros com o intuito de analisar sua expressão em resposta ao frio e também como proteção à deficiência hídrica, já que durante o congelamento a água é retirada das células, não estando disponível para a planta.

Palavras-chave: Análise in silico; Congelamento; Phaseolus vulgaris L.; Amnopiptanthus mongolicus